故事講述慈善機構濟拔堂賬目不清，在周年晚宴上，其財務總監楊滔（任達華 飾）身穿「還我清白」衣服自殺身亡，令主席高盛文（方中信 飾）感到困擾，因為濟拔堂被指涉及洗黑錢活動。隨後登場是大律師馬近風（郭富城 飾），為富二代被告洗脫強姦罪名後，卻不以為然，說了一句「程序贏了不代表真相大白」。

依照故事的發展，應該是「良心發現」的律師，聯同心思細密的警察柯定邦（吳鎮宇 飾），逐步揭開慈善機構洗黑錢內幕。不過麥兆輝導演有點貪心，想講「法律與公義」，又想加入動作場面，所以馬迎風恰好是位跆拳道教練，適合武鬥。

《內幕》開始時很有追看性，楊滔以自殺設局掀開黑幕–令人期待慈善機構背後是怎麼樣的犯罪脈絡，牽涉哪些權貴或重要人物，可是當幕後主腦賈元坤（駱應鈞 飾）出場後，劇情便每況愈下。

導演精心塑造的賈元坤先生，是位閒來讀莎士比亞作品，心狠手辣的狠人。駱應鈞也盡力表現角色深不可測的一面。可惜當他的背後關係曝光，竟然是與日本黑幫大佬合作販毒！

高盛文受到切手指及死亡威嚇後，更要接受差遣，利用慈善外訪活動掩飾親身帶二千萬美元現金，往金三角「買白粉」（賈先生語）！基本上到了這一幕，導演已親手煞停了這部電影，可能當下創作環境有很多制肘，不能觸碰更高層次的犯罪操作，只能以「販毒」橋段作結。接著高盛文真的帶同滿載現鈔的行李箱和毒販交易，這與電影一直想解釋機構迂迴的洗黑錢方式相比，有點諷刺。